Swift Umumkan Nilai Throughput Tertinggi untuk Metode Persiapan Single-Cell Methyl-Seq Library

Kajian yang diterbitkan majalah Science menunjukkan bagaimana epigenetic markers dapat mengidentifikasi cell subtypes dan regulatory elements yang meningkatkan keberagaman sel

ANN ARBOR, Michigan, 13 Agustus 2017 /PRNewswire/ -- Swift Biosciences, vendor terkemuka untuk innovative library prep solutions dalam next-generation sequencing (NGS), hari ini mengumumkan peluncuran metode perangkaian single-cell methylation terbaru berdasarkan teknologi Accel-NGS® Adaptase™ , sebauh NGS prep solution yang paling efisien dan lengkap untuk perangkaian whole-genome bisulfite dalam resolusi sel tunggal. Metode terbaru ini mendukung analisis methylated regions yang berbeda pada ribuan sel dari jaringan heterogen, sambil memenuhi beberapa kegunaan, seperti klasifikasi sel, regulasi mekanisme sel dalam jaringan tubuh yang normal, perubahan epigenesis dalam kondisi penyakit serta konservasi epigenomic regulation yang revolusioner.

Methylation merupakan biomarker stabil yang dapat dipakai untuk mengidentifikasi jenis sel dan regulatory element yang mendasari kegunaan sel. Ketika digabungkan dengan beberapa kajian RNA expression bersel tunggal, methylation bersel tunggal dapat menelaah regulatory element, yang mengendalikan berbagai unique expression dari setiap sel individual dan perbedaan di antara sel-sel tersebut. Selain itu, sejumlah kajian klinis telah mengungkap pola methylation pada penyakit –seperti kanker—yang mengidentifikasi jenis tumor, menilai beban tumor dalam liquid biopsies, dan menghubungkannya dengan perkembangan penyakit, prognosis dan respons obat.

Metode tersebut baru-baru ini digambarkan dalam makalah Science berjudul "Single Cell Methylomes Identify Neuronal Subtypes and Regulatory Elements in Mammalian Cortex" oleh beberapa kolaborator di Salk Institute, University of California San Diego dan Swift Biosciences. Alur kerja menggabungkan sel fluorescence-activated sorting-based isolation, konversi bisulfite dan modul Accel-NGS Adaptase Swift dengan berbagai komponen yang tersedia di pasaran. Hasil yang diterbitkan itu menunjukkan ada penambahan hingga dua kali lipat dalam tingkat read-mapping, jika dibandingkan dengan metode lain; dengan begitu, metode tersebut secara signifikan meningkatkan keluaran data per rangkaian sembari mengurangi keseluruhan biaya.

"Hal ini menjadi salah satu kerja sama sains ketika teknologi Swift mendorong batasan sains," kata Timothy Harkins, President & CEO, Swift Biosciences dan salah satu penulis makalah tersebut. "Kami sangat gembira atas data-data terbaru tentang proses sel dasar, dan dampak besar pada masa mendatang dalam pengobatan dengan keakuratan."

"Teknologi Adaptase kami yang dikembangkan sendiri membangun koleksi NGS dengan kerumitan yang tinggi dari DNA yang tergolong low-input dan single-stranded," ujar Laurie Kurihara, PhD, Senior Director, Research and Development, serta salah satu penulis makalah. "Alur kerja single-cell kami memiliki langkah yang lebih sedikit dibandingkan beberapa metode lain dan menawarkan proses multiplexed, single cell guna menghadirkan produktivitas yang lebih besar untuk penggunaan dengan aspek high- throughput."

Accel-NGS Adaptase Module kini tersedia di pasaran.